当寺の開創についてはいくつかの伝承があります。ひとつは寺伝です。当地の領主三井佐右衛門の父・寿光院は、天正十二年（1584）に徳川家康・織田信雄（のぶかつ）と豊臣秀吉が戦った小牧長久手の戦いに出陣、陣没しました。三井佐右衛門は父の霊を弔い、その武功を後世に伝える為に同じ年に当寺を開創したと伝えています。

当寺の過去の帳記録を見ますと、寿光院は元和元年（1615）十二月二十日に没しており、これは大坂夏の陣で豊臣家が滅亡した年です。二つの説を整理しますと、寿光院は徳川家の武将として大坂夏の陣で没し、その七回忌に当たる元和七年（1621）に、父の追善供養の為、領主三井佐右衛門が当寺を創健したものといえます。

開山は証蓮社誠譽順阿長応上人です。山号は、地名に由来し、院号と寺号は「寿光院殿清譽浄慶大居士」にちなんでつけられました。自然環境に恵まれた柿生の里にふさわしい庵の面影を保つべく、二十三世瑞譽浄香代の昭和四十二年頃から紫陽花を植え始め、現在では千株を超える花が咲き乱れ「柿生のあじさい寺」の愛称で親しまれています。